V Muzeu města Ústí nad Labem se nacházejí umělecké sbírky, sbírky o historii města, archeologické a přírodovědné exponáty. Muzeum se svými 200 000 exponáty, včetně 60 000 knih a 2 000 rukopisů a grafických listů, patří mezi nejvýznamnější regionální muzea v České republice.
Jedním ze stěžejních bodů je přírodovědná sbírka z 19. století, která představuje flóru a faunu severozápadních Čech, Českého středohoří a Krušných hor.
Historická část obsahuje 10 000 fotografií, negativů a historických pohlednic. Zbraně a další militaria ilustrují soudobé dějiny kolem roku 1813 (bitva u Chlumce). Od 18. listopadu 2021 je k vidění stálá výstava "Naši Němci" o Němcích v Čechách v průběhu přibližně 800 let. Jedná se o jedinou výstavu na toto téma v České republice.
Výtvarné umění a řemesla jsou zastoupeny pozdně gotickými dřevořezy a krajinomalbou 19. a 20. století, historickým nábytkem a zdobeným sklem.
Rozsahem i kvalitou sbírek se Muzeum města Ústí nad Labem řadí mezi nejvýznamnější regionální muzejní instituce v České republice.