Das Museum Ústí nad Labem verwahrt die Kunstsammlungen der Stadt, die Sammlungen zur Stadtgeschichte sowie archäologische und naturwissenschaftliche Ausstellungsstücke. Mit seinem Bestand von 200.000 Exponaten, darunter 60.000 Bücher sowie 2000 Handschriften und grafische Blätter, gehört das Museum zu den wichtigsten Regionalmuseen in der Tschechischen Republik.
Einen Schwerpunkt bildet die Naturwissenschaftliche Sammlung aus dem 19. Jahrhundert, welche Flora und Fauna in Nordwest-Böhmen, im Böhmischen Mittelgebirge und im Erzgebirge vorstellt.
In der historischen Abteilung befinden sich u.a. 10.000 Fotografien, Negative und historische Postkarten. Waffen und andere Militaria illustrieren die Zeitgeschichte um 1813 (Schlacht beim Kulm).
Ein besonderes Highlight ist die Dauerausstellung "Unsere Deutschen" über die deutschsprachige Bevölkerung in Böhmen und Mähren im Laufe von rund 800 Jahren. Sie ist die einzige Ausstellung zu diesem Thema in Tschechien.
Bildende Kunst und Kunsthandwerk sind mit spätgotischen Holzschnitten und Landschaftsmalerei des 19. und 20. Jahrhunderts sowie historischen Möbeln und kunstvollem Glas vertreten.
Sowohl die Anzahl als auch die Qualität der Sammlungen machen das Museum der Stadt Ústí nad Labem zu einer der wichtigsten regionalen Museumsinstitutionen in der Tschechischen Republik.